申請房屋糾紛仲裁的方式是：申請人填寫仲裁申請書，雙方提交相關的證據，由雙方共同選定或者委托仲裁委主任指定一名仲裁員獨任審理，仲裁裁決自作出之日起發生法律效力。

可以仲裁的房地產糾紛是：

1.房屋買賣爭議；

2.房屋所有權的爭議；

3.房屋使用權爭議；

4.他項權利與相鄰關系。

【法律依據】

根據《仲裁法》第四條，當事人采用仲裁方式解決糾紛，應當雙方自愿，達成仲裁協議。沒有仲裁協議，一方申請仲裁的，仲裁委員會不予受理。